研究发现，（1）受控于包括青藏高原和台湾岛隆升、海盆扩张等在内的构造运动和气候变化，以及东亚大型河流发育、海底峡谷演化、海平面升降等一系列控制因素的叠加影响，南海海盆沉积通量随时间不断增加，但不同时期增长速率并不一致（图2）；（2）南海西南次海盆和西北次海盆在特定的地质历史时期分别有一期沉积通量异常下降事件：前者发生在晚中新世期，可能与湄公陆坡区的沉积捕获有关；而后者在上新世期间，主要与该阶段处于高海平面时期，沉积主要堆积在北部陆缘宽阔的陆架区，导致陆坡区峡谷体系（如中央峡谷）发生退缩相关；（3）上新世期间，南海海盆内沉积物分布格局发生改变（图3E）。在此之前海盆内沉积物主要集中在海盆北翼，沉积中心主要分布在深水河道/海底峡谷系统的出口和陆坡坡脚处，逐渐向海盆中央扩散；其后由于海平面升高和湄公河径流的增加，沉积中心逐渐向海盆西南方向转移。一个例外是上新世晚期在南海海盆东北部形成的与台湾岛隆升相关的巨大沉积中心，由于持续的隆升造山运动导致了极大的风化剥蚀，陆相沉积物通过河流和峡谷水道输送，在海盆内形成厚度超过～1000m的扇形堆积体（图3F）。